Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtf1A2AQ19 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms