Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp8nlA2ABX0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms