Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdc27A2A6Q5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms