Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms