Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l1A2A259 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms