Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms