Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trbv26A0A0B4J1P5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trbv26A0A0B4J1P5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trbv26A0A0B4J1P5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trbv26A0A0B4J1P5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trbv26A0A0B4J1P5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trbv26A0A0B4J1P5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv26A0A0B4J1P5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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