Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms