Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv13-3A0A0B4J1H2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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