Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G9

Trbv5, T cell receptor beta, variable 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv5A0A0B4J1G9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms