Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms