Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRMP28827 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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