Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms