Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PKP4Q99569 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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PKP4Q99569 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
PKP4Q99569 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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PKP4Q99569 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PKP4Q99569 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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PKP4Q99569 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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PKP4Q99569 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PKP4Q99569 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PKP4Q99569 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PKP4Q99569 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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PKP4Q99569 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PKP4Q99569 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PKP4Q99569 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PKP4Q99569 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PKP4Q99569 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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