Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
LRRIQ1Q96JM4 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms