Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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