Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms