Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDGFDQ9GZP0 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms