Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms