Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ALCAMQ13740 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ALCAMQ13740 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms