Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
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PTCH1Q13635 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
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PTCH1Q13635 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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