Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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TCOF1Q13428 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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TCOF1Q13428 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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TCOF1Q13428 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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TCOF1Q13428 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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TCOF1Q13428 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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