Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.5 ms