Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC079834.1-201ENST00000414016 421 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 TAC3-205ENST00000415231 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 EIF3KP2-201ENST00000415266 626 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL450322.1-201ENST00000415358 313 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL121990.1-201ENST00000417605 591 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC073188.2-201ENST00000424036 701 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC152007.1-201ENST00000428521 224 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL139412.1-201ENST00000441085 523 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL606468.1-201ENST00000444750 510 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC099681.1-201ENST00000454777 552 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RN7SL77P-201ENST00000473332 294 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPSAP38-201ENST00000475442 881 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RN7SL252P-201ENST00000496274 297 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC098680.1-201ENST00000506010 367 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 KRT18P54-201ENST00000513396 748 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 GNPDA1-212ENST00000513454 980 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ATOX1-202ENST00000520382 466 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC01606-206ENST00000520929 411 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LRTOMT-216ENST00000539271 570 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 TROAP-209ENST00000549275 348 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC02304-201ENST00000554445 445 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 OTX2-204ENST00000554788 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC093249.5-201ENST00000568120 430 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC104770.1-202ENST00000573698 325 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RN7SL123P-201ENST00000577239 292 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC090772.2-201ENST00000578443 564 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC018521.3-201ENST00000581213 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC139085.1-201ENST00000582716 182 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RN7SL474P-201ENST00000583485 301 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MIR663AHG-230ENST00000609012 708 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MIR6744-201ENST00000619480 66 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC097493.5-201ENST00000641103 1010 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ZNF567-204ENST00000588311 2042 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 PSG9-209ENST00000621109 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL590065.1-201ENST00000603371 4774 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RAB13-205ENST00000614713 1353 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL450998.1-201ENST00000321418 438 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms