Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SREBF2Q12772 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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SREBF2Q12772 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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SREBF2Q12772 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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SREBF2Q12772 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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SREBF2Q12772 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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SREBF2Q12772 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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SREBF2Q12772 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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SREBF2Q12772 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SREBF2Q12772 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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