Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SCN11AQ9UI33 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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