Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 UTY-215ENST00000618474 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 NLGN4X-204ENST00000381095 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 NAIP-208ENST00000517649 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 OR2M4-202ENST00000641868 5934 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LAMA3Q16787 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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