Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
R3HDM1Q15032 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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