Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NDUFA9Q16795 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms