Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms