Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms