Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CDKN3Q16667 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms