Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms