Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W1

Gm3839, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3839S4R1W1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3839S4R1W1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3839S4R1W1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm3839S4R1W1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm3839S4R1W1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm3839S4R1W1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm3839S4R1W1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm3839S4R1W1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm3839S4R1W1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm3839S4R1W1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm3839S4R1W1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm3839S4R1W1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm3839S4R1W1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm3839S4R1W1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm3839S4R1W1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3839S4R1W1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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