Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms