Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Padi1Q9Z185 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi1Q9Z185 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi1Q9Z185 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi1Q9Z185 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi1Q9Z185 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi1Q9Z185 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi1Q9Z185 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi1Q9Z185 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi1Q9Z185 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi1Q9Z185 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi1Q9Z185 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi1Q9Z185 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi1Q9Z185 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi1Q9Z185 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi1Q9Z185 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi1Q9Z185 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi1Q9Z185 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi1Q9Z185 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi1Q9Z185 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi1Q9Z185 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Padi1Q9Z185 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms