Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme3Q9WV85 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms