Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf13bQ9WU72 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms