Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms