Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nr2e3Q9QXZ7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2e3Q9QXZ7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms