Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ6

Slco1a1, Solute carrier organic anion transporter family member 1A1, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1a1Q9QXZ6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1a1Q9QXZ6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1a1Q9QXZ6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1a1Q9QXZ6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1a1Q9QXZ6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1a1Q9QXZ6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1a1Q9QXZ6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1a1Q9QXZ6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1a1Q9QXZ6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1a1Q9QXZ6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1a1Q9QXZ6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms