Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms