Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phc2Q9QWH1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms