Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ap3b2Q9JME5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b2Q9JME5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms