Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM93

Arl6ip4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip4Q9JM93 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arl6ip4Q9JM93 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arl6ip4Q9JM93 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Arl6ip4Q9JM93 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arl6ip4Q9JM93 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arl6ip4Q9JM93 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arl6ip4Q9JM93 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arl6ip4Q9JM93 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arl6ip4Q9JM93 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arl6ip4Q9JM93 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arl6ip4Q9JM93 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Arl6ip4Q9JM93 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arl6ip4Q9JM93 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arl6ip4Q9JM93 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arl6ip4Q9JM93 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arl6ip4Q9JM93 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arl6ip4Q9JM93 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arl6ip4Q9JM93 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arl6ip4Q9JM93 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arl6ip4Q9JM93 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arl6ip4Q9JM93 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arl6ip4Q9JM93 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arl6ip4Q9JM93 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arl6ip4Q9JM93 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms