Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms