Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pkd2l2Q9JLG4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms