Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms