Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mrpl39Q9JKF7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mrpl39Q9JKF7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mrpl39Q9JKF7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Mrpl39Q9JKF7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Mrpl39Q9JKF7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Mrpl39Q9JKF7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mrpl39Q9JKF7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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