Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap3m1Q9JKC8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3m1Q9JKC8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms